数据集概述
本数据集包含与Rtapas R包相关的文件，Rtapas用于评估两个进化历史间的协同进化信号，可处理大型系统发育树，适用于复杂宿主-共生体进化历史分析及不同DNA标记系统发育树的拓扑一致性评估。
文件详解
- README.md: Markdown格式文件，介绍Amph_Trem.zip的内容，包括新西兰南部7个地点的吸虫（Coitocaecum parvum）和端足类宿主（Paracalliope fluviatilis）线粒体细胞色素氧化酶亚基1单倍型数据
- Amph_Trem.zip: 压缩文件，包含吸虫（Cparvum.tre）和宿主（m_Cparvum.tre等）的系统发育树文件（Nexus格式）
- Mam_Fleas.zip: 压缩文件，可能包含哺乳动物与跳蚤相关的系统发育数据
- SuppMat.pdf: PDF格式文件，补充材料文档
- Nucl_Plast.zip: 压缩文件，可能包含核基因与质体基因相关的系统发育数据
适用场景
- 协同进化研究: 分析宿主-共生体复杂进化历史中的协同进化信号
- 系统发育一致性评估: 比较不同DNA标记构建的系统发育树拓扑一致性
- 基因树进化分析: 识别最可能反映基因树进化历史的基因子集
- 大型系统发育分析: 处理包含100+末端分类单元的大型系统发育树
- 进化生物学方法验证: 验证Rtapas包中协同进化分析算法的有效性
