数据集概述
本数据集为冲绳珊瑚礁深度梯度生物多样性调查的原始数据,基于快速通用宏条形码调查(RUMS)方法,通过18S rRNA基因分析沉积物环境DNA(eDNA),探究10-40米深度梯度下真核生物群落组成差异,重点分析不同类群的深度分带特征,为珊瑚礁生态系统监测提供基础数据。
文件详解
- 文件名称:
README_for_PeerJ Raw Data Submission.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:包含数据集提交的说明文档,可能涉及实验背景、方法概述、数据处理流程及文件内容说明等辅助信息。
- 文件名称:
PeerJ Raw Data Submission.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包文件,推测包含18S rRNA宏条形码测序的原始数据、真核生物分类单元注释结果、深度梯度群落组成统计等核心实验数据。
数据来源
论文“Digging for DNA at depth: rapid universal metabarcoding surveys (RUMS) as a tool to detect coral reef biodiversity across a depth gradient”
适用场景
- 珊瑚礁生态监测: 分析深度梯度下真核生物群落结构变化,评估珊瑚礁生态系统健康状态。
- 海洋生物多样性研究: 基于eDNA数据探究冲绳珊瑚礁从微生物到大型生物的物种组成及分布特征。
- 宏条形码方法验证: 验证RUMS方法在珊瑚礁沉积物eDNA调查中的应用潜力与局限性。
- 深度分带特征分析: 研究不同生物类群(如海绵、珊瑚)的深度适应性及指示物种筛选。
- 生态保护决策支持: 为珊瑚礁保护区的深度梯度监测方案制定提供数据参考。