数据集概述
本数据集围绕非洲濒危猴类Rungwecebus kipunji的基因渐渗生物地理学研究展开,包含支持其分类地位的基因序列及分析文件,涉及线粒体DNA渐渗现象的验证,为该物种作为独立属的分类学争议提供数据支撑。
文件详解
- 基因序列文件(.nex格式)
- 文件名称:co1.nex、combined.nex、nd45.nex、12S.nex、co2.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:包含Rungwecebus kipunji及相关物种的基因序列数据,用于构建系统发育树和分析基因渐渗关系
- 分析结果与命令文件(.zip格式)
- 文件名称:ML_bootstrapping.zip、consensus_trees.zip、command_files.zip、MP_bootstrapping.zip、SH_test_trees.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含最大似然法(ML)和最大简约法(MP)的自举分析结果、共识树文件、分析命令脚本及SH检验树文件,支持分类地位验证和基因渐渗分析
数据来源
论文“The biogeography of introgression in the critically endangered African monkey Rungweceubs kipunji”
适用场景
- 生物分类学研究:验证Rungwecebus kipunji作为独立属的分类地位,分析其与Papio属的系统发育关系
- 基因渐渗机制分析:探究地理局部化线粒体DNA渐渗现象的发生机制及种群遗传效应
- 濒危物种保护遗传学:为Rungwecebus kipunji的濒危等级评估和保护策略制定提供基因数据支撑
- 生物地理学研究:分析该物种不同地理种群(Southern Highlands与Ndundulu)的基因差异及演化历史
- 分子系统发育分析:利用基因序列数据构建物种系统发育树,研究非洲猴类的演化关系