数据集概述
本数据集聚焦奶牛瘤胃微生物群对饮食变化的响应，评估不同粗饲料与精饲料比例（65:35 vs 35:65）及添加葵花籽油（0或50g/kg干物质）对瘤胃微生物的影响。通过qPCR、T-RFLP和宏条形码测序分析微生物群落结构，包含细菌、古菌、纤毛虫原生动物和真菌的丰度、多样性及共现网络数据，共5个文件。
文件详解
- Sequence metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含测序样本的元数据信息，可能涉及实验处理（饮食比例、葵花籽油添加）、样本采集时间、奶牛个体信息等关键背景数据
- archaea.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：包含古菌群落的测序数据，可能涉及古菌分类群丰度、多样性指数（如Simpson指数）、物种组成（如Methanobrevibacter属）等分析结果
- ciliate.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：包含纤毛虫原生动物群落的测序数据，涉及分类群丰度、群落结构及饮食干预对其的影响数据
- bacteria.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：包含细菌群落的测序数据，涉及细菌分类群丰度（如Firmicutes、Bacteroidetes门）、多样性及饮食相关的群落变化数据
- fungi.tar.gz
- 文件格式：GZ压缩包
- 字段映射介绍：包含真菌群落的测序数据，涉及真菌分类群丰度、多样性变化（如高精料饮食对真菌的抑制作用）及饮食与葵花籽油的交互影响数据
适用场景
- 瘤胃微生物组饮食响应研究：分析粗精料比例、葵花籽油添加对瘤胃细菌、古菌、真菌及纤毛虫群落结构的影响
- 反刍动物营养调控：探究饮食干预下瘤胃微生物多样性变化与发酵功能（如产甲烷）的关联，为奶牛饲料优化提供依据
- 微生物共现网络分析：通过微生物互作网络数据，研究瘤胃微生物群落内的相互关系及饮食对网络结构的调控
- 微生物分类群丰度研究：对比不同饮食处理下特定微生物类群（如Methanobrevibacter属）的丰度差异，解析其与饮食的关联
