数据集概述
本数据集包含研究“入侵外来捕食者颠覆生物复杂性空间尺度定律”的原始数据与R分析代码,支持复现研究中的模型分析与图表生成,为理解入侵物种对生态系统空间尺度规律的影响提供完整的可复现资源。
文件详解
该数据集为压缩包形式,内部包含多个子文件夹及文件,具体说明如下:
- 根目录文件:
- Supplementary_Materials_Zenodo.zip:压缩包,包含所有数据与代码文件
- Data文件夹(数据文件):
- Inventory_data_formatted.txt:原始生物多样性采样数据,每行记录一次采样中的一个物种,字段包括栖息地类型、采样点ID、年份、月份、物种、采样技术、栖息地面积、采样会话ID
- Observation_matrix.txt:61×61矩阵,记录文献中 trophic 相互作用的研究次数(0表示无记录,正整数表示研究次数)
- Paper_list.txt:文献综述所用论文列表,字段包括作者、年份、标题、期刊、卷号、DOI
- Taxa_names_matrices.txt:metaweb中 trophic 物种名称列表
- Trophic_link_matrix.txt:61×61矩阵,记录文献中报告的 trophic 相互作用(NA表示无观测数据)
- Metaweb文件夹(元网络相关代码与数据):
- Missing_links子文件夹:包含JAGS模型脚本、缺失链接填充脚本及加权链接矩阵文件
- Metaweb_figure子文件夹:包含绘制元网络图表的R脚本与函数
- Species_role_figure子文件夹:包含绘制物种角色图表的R脚本
- Local_food_webs文件夹(本地食物网相关代码与数据):
- Local_food_web_reconstruction子文件夹:包含本地食物网重建脚本、函数及重建结果文件
- Surface_bioinvaders_Model_and_Figure子文件夹:包含入侵物种丰度-面积关系模型脚本与图表生成代码
- Surface_community_Models_and_Figure子文件夹:包含群落尺度模型脚本与函数
- Surface_food_webs_Models_and_Figure子文件夹:包含食物网尺度模型脚本与函数
适用场景
- 生态学研究:复现入侵物种对生物复杂性空间尺度定律影响的分析结果
- 生态模型开发:基于提供的R代码与数据,扩展研究入侵物种对食物网结构的影响
- 教学实践:作为生态数据分析与可复现研究的教学案例
- 生物入侵管理:为评估入侵捕食者对本地生态系统的影响提供数据支持
- 空间生态学研究:探究栖息地面积与生物多样性、食物网复杂性的关系模型