数据集概述
本数据集包含论文《Molecular Architecture of the Major Membrane Ring Component of the Nuclear Pore Complex》（2017年发表于Structure）相关的建模文件与分析数据，由Sali实验室提供。数据涵盖核孔复合体主要膜环组件的分子结构建模轨迹、电子显微镜相关数据及聚类分析结果等，共18个文件，支持研究人员复现相关建模工作。
文件详解
- 压缩包文件（.zip格式，共12个）
- 典型文件：pom152-master.zip、em2d_T1_truncation_1-1135.zip、data.zip、Pom152_em3d_Final.zip、MODELLER_26994.zip、em2d_T2_truncation_1-936.zip、kmeans_1000_2.zip
- 内容说明：包含核孔复合体膜环组件（如Pom152）的分子建模基础文件、二维/三维电子显微镜数据、MODELLER建模输出文件及聚类分析结果等
- 压缩包文件（.xz格式，共5个）
- 典型文件：modeling_trajectories_set4.tar.xz、modeling_trajectories_set2.tar.xz、modeling_trajectories_set5_within_NPC.tar.xz、modeling_trajectories_set1.tar.xz
- 内容说明：包含不同组别的分子结构建模轨迹数据，如核孔复合体内建模轨迹（set5_within_NPC）
- 分子动力学轨迹文件（.dcd格式，共1个）
- 文件名称：cluster0.dcd
- 内容说明：聚类分析得到的第0类分子动力学轨迹数据
数据来源
Sali lab（论文《Molecular Architecture of the Major Membrane Ring Component of the Nuclear Pore Complex》，Upla et al.，Structure 2017）
适用场景
- 核孔复合体结构生物学研究：分析主要膜环组件的分子结构与组装机制
- 生物分子建模方法验证：复现论文中的分子建模流程，验证相关算法与工具的应用效果
- 电子显微镜数据解析：利用二维/三维电子显微镜数据研究核孔复合体膜环组件的空间构象
- 分子动力学轨迹分析：通过建模轨迹数据探究核孔复合体膜环组件的动态变化特性
- 生物大分子聚类研究：基于聚类分析结果（如cluster0.dcd）分析分子结构的分类特征
