数据集概述
本数据集包含用于酵母核孔复合体（NPC）中Nup133亚基建模的脚本和相关数据，涉及IMP、MODELLER、FoXS、AllosMod及Minimal Ensemble Search等工具的应用，覆盖从初始模型构建到构象采样、模型筛选与验证的完整流程。
文件详解
- Crosslinks.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含用于模型验证的化学交联数据文件
- SAXS.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含小角X射线散射（SAXS）原始数据及相关分析文件
- nup133-master.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含Nup133亚基建模的主脚本及核心配置文件
- MODELLER.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含使用MODELLER工具生成初始比较模型的脚本及输入输出文件
- ISAC.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含与电子显微镜类平均数据相关的模型筛选文件
数据来源
Sali lab website
适用场景
- 蛋白质结构建模研究: 用于酵母核孔复合体Nup133亚基的三维结构建模与优化
- 生物信息学工具应用: 学习IMP、MODELLER等蛋白质建模工具的联合使用流程
- 结构生物学数据整合: 整合SAXS、电镜、交联数据进行多源约束的蛋白质结构预测
- 核孔复合体结构分析: 辅助解析酵母核孔复合体的整体组装机制与功能研究
