数据集概述
本数据集围绕大西洋鲑鱼肠道微生物组的生物地理学展开,包含从大西洋不同区域采集的96条涵盖淡水和海水生活阶段的大西洋鲑鱼样本信息。数据聚焦肠道微生物群落的多样性、组成及其与生命周期阶段的关联,为研究鱼类宿主-微生物互作及迁徙对肠道菌群的影响提供基础。
文件详解
- README_for_raw_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含样本ID(SampleID)、条形码序列(BarcodeSequence)、采样地点(Site)、国家(Country)、生命周期阶段(Lifecycle_stage)、水体类型(Water)、备注(Comments)、鱼类来源(Fish origin)等字段信息,记录样本的基础元数据。
- raw_data.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:压缩包内包含原始数据文件,具体内容需解压后查看。
数据来源
论文“The biogeography of the atlantic salmon (Salmo salar) gut microbiome”
适用场景
- 鱼类肠道微生物组研究: 分析大西洋鲑鱼肠道微生物群落的组成、多样性及其与生命周期阶段的关系。
- 生物地理学分析: 探究地理因素对大西洋鲑鱼肠道微生物组的影响。
- 宿主-微生物互作研究: 研究宿主生命周期变化与肠道微生物群落动态的关联机制。
- 生态环境适应性分析: 分析淡水与海水生活阶段对大西洋鲑鱼肠道微生物组的影响。