数据集概述
本数据集包含大西洋鲑鱼全分布区平行气候相关基因组梯度分析的核心数据，涵盖134个北美及欧洲种群的1773个全基因组单核苷酸多态性位点信息，识别出与纬度和季节温度相关的梯度位点，为研究该物种的局部适应性及气候变化影响提供基础数据。
文件详解
- 文件名称：ClinalLoci_GP.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含显示梯度模式的位点数据，涉及北美84个位点、欧洲195个位点及跨大陆共有的12个位点的基因型与地理梯度关联信息
- 文件名称：EnvironmentalData.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含与梯度位点关联的环境数据，主要涉及纬度及季节温度（尤其是春季平均温度）等气候参数
- 文件名称：R_scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于分析基因组梯度模式、环境关联及平行进化的R语言脚本文件
- 文件名称：AllRivers_Oct2016_1773LociGP.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含1773个全基因组位点的基础信息，涉及位点编号（如AY388596_a、BASS10_B7_F03_186等）及所有河流种群的基因型数据
数据来源
论文“Range wide parallel climate-associated genomic clines in Atlantic salmon”
适用场景
- 进化生物学研究: 分析大西洋鲑鱼跨大陆的平行进化模式及遗传结构差异
- 气候变化适应性评估: 基于气候相关基因组梯度位点，预测物种对气候变化的响应潜力
- 水产育种应用: 识别与环境适应性相关的功能位点，为抗逆品种选育提供分子标记
- 生物地理学分析: 结合地理梯度数据，研究大西洋鲑鱼种群分布与环境因子的关联机制
- 基因组学方法验证: 利用平行梯度分析的R脚本，复现或优化基因组-环境关联分析流程
