数据集概述
本数据集包含巴西萨尔瓦多市9个采样点146只挪威鼠（Rattus norvegicus）的种群遗传学研究数据，通过17个微卫星位点分析遗传变异、种群结构及基因流模式。数据反映城市异质景观下鼠类复杂遗传结构，为制定针对性啮齿动物控制策略提供依据，共含25个文件。
文件详解
- 基因型数据文件
- 文件名称：
SalvadorRatMsatGenotypes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含146只挪威鼠的17个微卫星位点基因型原始数据
- 种群遗传学分析文件（按工具分类）
- ML-RELATE相关文件（
.txt格式，如RatDems-ML-RELATE-PL8-V2.txt等19个文件）
- 内容：基于微卫星位点的亲缘关系分析结果，包含位点名称（如D4Cebr2、D19Wox11等）及种群编号等信息
- GENEPOP分析文件
- 文件名称：
RatDemographics-GENEPOP-PL8sep.txt
- 文件格式：TXT
- 内容：适用于GENEPOP软件的种群遗传学分析输入/输出数据
- ARLEQUIN分析文件
- 文件名称：
RatDemographics-ARLEQUIN.arp、RatDemographics-ARLEQUIN-PL8sep.ars
- 文件格式：ARP、ARS
- 内容：适用于ARLEQUIN软件的种群遗传结构分析数据
- 其他分析文件（
.gen、.dat格式，如RatDemsPL8sep.gen、RatDemsPL8sep.dat）
- 内容：种群遗传聚类、基因流分析相关的中间或结果数据
数据来源
论文“Urban population genetics of slum-dwelling rats (Rattus norvegicus) in Salvador, Brazil”
适用场景
- 城市啮齿动物种群遗传学研究：分析挪威鼠种群遗传多样性、结构及基因流模式
- 公共卫生策略制定：基于遗传数据制定针对性的城市贫民窟鼠类控制与根除方案
- zoonotic病原体传播风险评估：结合鼠类种群结构分析疾病传播的空间关联性
- 城市生态与景观遗传学研究：探究异质城市环境对啮齿动物种群遗传结构的影响机制
- 种群控制效果评估：为后续鼠类控制措施的效果提供遗传层面的监测依据
