数据集概述
本数据集围绕三刺鱼从海洋入侵淡水湖泊后,基因表达可塑性在新环境适应中的作用展开。通过对比海洋祖先种群与淡水衍生种群在7°C和22°C极端温度下的基因表达差异,分析了超14000个基因的可塑性,发现淡水种群具有更多可塑性表达基因,为环境适应的分子机制研究提供数据支持。
文件详解
- 数据文件:
- Normalized_Filtered_GeneExpressionData.xlsx:Excel格式,包含标准化和过滤后的基因表达数据
- LIMMA_Results_SupplementalMaterials.xlsx:Excel格式,可能包含差异表达分析结果
- MicroarrayNo7.xlsx、MicroarrayNo10.xlsx:Excel格式,芯片原始或处理数据
- targets.txt:TXT格式,包含样本元数据,字段有SampleNumber、FileName、Origin、Population、Temperature、Tank、Sex、Array等
- 分析结果文件:
- GO_summary.xlsx:Excel格式,基因本体(GO)分析汇总数据
- 系列PDF文件(如GO_fwall_22deg_cellular.pdf、GO_marineall_7deg_molecular.pdf等):共12个PDF文件,展示不同条件下基因本体分析结果,涉及细胞组分、分子功能等类别
- 代码文件:
- MatlabCode_Contrasts.m:Matlab代码文件,用于基因表达对比分析
适用场景
- 进化生物学研究:分析基因表达可塑性在物种环境适应中的作用
- 分子生物学研究:探究温度胁迫下基因表达调控机制
- 生物信息学分析:验证基因本体富集分析方法及结果
- 环境适应机制研究:解析淡水殖民化过程中关键基因(如PPARAa)的功能作用