三刺鱼淡水湖泊殖民化基因表达可塑性数据集

数据集概述

本数据集围绕三刺鱼从海洋入侵淡水湖泊后,基因表达可塑性在新环境适应中的作用展开。通过对比海洋祖先种群与淡水衍生种群在7°C和22°C极端温度下的基因表达差异,分析了超14000个基因的可塑性,发现淡水种群具有更多可塑性表达基因,为环境适应的分子机制研究提供数据支持。

文件详解

  • 数据文件:
  • Normalized_Filtered_GeneExpressionData.xlsx:Excel格式,包含标准化和过滤后的基因表达数据
  • LIMMA_Results_SupplementalMaterials.xlsx:Excel格式,可能包含差异表达分析结果
  • MicroarrayNo7.xlsx、MicroarrayNo10.xlsx:Excel格式,芯片原始或处理数据
  • targets.txt:TXT格式,包含样本元数据,字段有SampleNumber、FileName、Origin、Population、Temperature、Tank、Sex、Array等
  • 分析结果文件:
  • GO_summary.xlsx:Excel格式,基因本体(GO)分析汇总数据
  • 系列PDF文件(如GO_fwall_22deg_cellular.pdf、GO_marineall_7deg_molecular.pdf等):共12个PDF文件,展示不同条件下基因本体分析结果,涉及细胞组分、分子功能等类别
  • 代码文件:
  • MatlabCode_Contrasts.m:Matlab代码文件,用于基因表达对比分析

适用场景

  • 进化生物学研究:分析基因表达可塑性在物种环境适应中的作用
  • 分子生物学研究:探究温度胁迫下基因表达调控机制
  • 生物信息学分析:验证基因本体富集分析方法及结果
  • 环境适应机制研究:解析淡水殖民化过程中关键基因(如PPARAa)的功能作用
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 449.81 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。