数据集概述
本数据集是论文《SARS-CoV-2冠状病毒大流行期间序列组成复杂性的适应性趋势》的补充数据，包含病毒基因组序列组成复杂性（SCC）分析相关的表格、系统发育树、序列文件等，支持对病毒进化适应性趋势的研究。
文件详解
该数据集包含多个文件和压缩包，具体说明如下：
- 补充表格文件:
- SupplementaryTables S1-S19.zip: 压缩包格式，包含Excel补充表格，记录每个分析基因组的菌株名称、采集日期和SCC值。
- SupplementaryTable S20.pdf: PDF格式，列出Nextstrain样本分析所用基因序列的作者、原始及提交实验室的致谢名单。
- 系统发育树文件:
- nextstrain_ncov_open_global_timetree.nwk: Newick格式文件，为Nextstrain样本的最大似然（ML）系统发育动力学树。
- PhylogeneticTimetrees_NewickFormat.zip: 压缩包格式，包含6个Newick格式的系统发育时间树。
- 序列文件:
- Nextstrain_sample_fasta_3059.zip: 压缩包格式，包含Nextstrain样本的Fasta格式序列。
- 说明文件:
- README_file.txt: 文本格式，为论文补充数据的说明文档。
适用场景
- 病毒进化研究: 分析SARS-CoV-2冠状病毒基因组序列组成复杂性的时间变化趋势。
- 系统发育分析: 基于提供的系统发育树和序列数据，探究病毒的进化动力学特征。
- 适应性进化机制研究: 验证病毒高适应性变异株出现前后SCC的变化与选择压力的关系。
- 分子流行病学研究: 结合病毒采集时间和基因组数据，追溯病毒传播和变异路径。
