数据集概述
本数据集基于核糖体图谱技术,分析SARS-CoV-2感染模型细胞系及原代气道细胞后的翻译调控事件,揭示病毒对宿主mRNA翻译的影响,包括先天免疫基因表达抑制等机制,为治疗开发提供靶点。
文件详解
该数据集包含17个文件,主要为表格和文档类文件,具体如下:
- Excel表格文件(.xlsx格式,共9个):
- 差异表达分析结果:如Table S13-HBEC_ribo-seq-DE-summary.xlsx(HBEC细胞核糖体测序差异表达总结)、Table S12-HBEC_RNA-seq-DE-summary.xlsx(HBEC细胞RNA测序差异表达总结)、Table S9-Vero_ribo-seq-DE-summary.xlsx(Vero细胞核糖体测序差异表达总结)
- 翻译效率数据:如Table S14-Vero-TE-tables.xlsx(Vero细胞翻译效率表格)
- 测序数据比对总结:如Table-S6-HBEC-SARS-CoV-2-mapping-summary.xlsx(HBEC细胞SARS-CoV-2序列比对总结)
- Word文档文件(.docx格式,共7个):
- 补充表格:如Table S1.docx、Table S2.docx、Table S4.docx、Table S5.docx(基础数据表格)
- 替代翻译起始位点数据:如Table S7-AltTIS.docx(替代翻译起始位点信息)
- 核糖体分析数据:如Table S10.docx(核糖体分析相关数据)
- PDF文件(.pdf格式,共1个):
- 补充图表:Figures-supp-031622.pdf(补充图表集合)
适用场景
- 病毒学研究:分析SARS-CoV-2复制过程中mRNA翻译调控机制
- 免疫学研究:探究病毒对宿主先天免疫基因表达的抑制机制
- 药物开发:识别病毒翻译调控相关的治疗靶点
- 细胞生物学研究:比较不同细胞系对病毒感染的翻译应答差异
- 测序数据分析:验证核糖体图谱与RNA测序联合分析的方法学应用