SATé_II_Based_多序列比对与系统发育树估计数据集

数据集概述

本数据集包含SATé-II算法相关的多序列比对与系统发育树估计数据,支持对该算法在速度、比对准确性及系统发育树准确性方面的研究。SATé-II是一种元方法,可提升现有多序列比对方法的质量,适用于分析大型数据集,数据集包含4个文件,涵盖说明文档与压缩包。

文件详解

  • 说明文档(.txt格式)
  • 文件名称:README_for_16S.B.ALL.txt、README_for_16S.T.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:提供对应压缩包的内容说明,如16S.T.zip的README文件说明其包含4个文件,其中非说明文件为nexus格式的比对与树数据文件
  • 压缩包文件(.zip格式)
  • 文件名称:16S.T.zip、16S.B.ALL.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:16S.T.zip包含nexus格式文件,如16S.T.reference.combined.nex(含 curated比对与RAxML树)、16S.T.SATEII.combined.nex(SATé-II生成的比对与树)、16S.T.RAX_MFAS.combined.nex等,记录相关数据集的比对结果与系统发育树

适用场景

  • 生物信息学算法评估: 用于分析SATé-II算法在多序列比对与系统发育树估计中的速度、准确性表现
  • 序列比对方法研究: 对比SATé-II提升后的比对方法与原始方法的质量差异
  • 系统发育树构建研究: 基于数据集中的树文件,探究不同方法生成的系统发育树的准确性
  • 算法优化分析: 研究SATé-II的分治重比对技术对结果性能的影响机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 338.18 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。