数据集概述
本数据集记录挪威中部高山地区沿脊到雪床梯度的真菌群落组成变化,包含50个Bistorta vivipara植物根系样本的真菌多样性及群落组成分析结果,涉及土壤碳氮磷含量等环境变量,共14个文件。
文件详解
- 说明文件(README)
- 文件名称:README_for_SBFY1.734.txt、README_for_SBFY2.735.txt、README_for_SBFY3.736.txt、README_for_SBFY4.737.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含qiime数据处理的映射文件信息,如SampleID、BarcodeSequence、LinkerPrimerSequence、ReversePrimer、SampleType(Ridge/Snowbed)等。
- 原始测序文件(SFF)
- 文件名称:SBFY1.734.sff、SBFY2.735.sff、SBFY3.736.sff、SBFY4.737.sff
- 文件格式:SFF
- 字段映射介绍:454焦磷酸测序原始数据文件,记录真菌ITS1扩增子测序信息。
- 数据文件
- 文件名称:RAW_OTU_table w tax.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含操作分类单元(OTU)表及分类学信息;otu_table.from_biom_.txt为biom格式转换后的OTU表文本文件;veg_.txt为植被相关数据;variables.txt为环境变量数据。
- 代码文件(R)
- 文件名称:GNMDS.R、Accum&Spec_div_.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:包含非度量多维尺度分析(GNMDS)及物种累积和多样性分析的代码。
数据来源
论文“Substantial compositional turnover of fungal communities in an alpine ridge-to-snowbed gradient”
适用场景
- 高山生态系统真菌群落研究: 分析沿脊到雪床梯度的真菌群落组成变化及驱动机制。
- 环境因子与真菌关系分析: 探究土壤碳氮磷含量对真菌群落的影响。
- 真菌多样性评估: 基于OTU数据研究高山真菌物种丰富度及组成特征。
- 生态梯度响应研究: 揭示真菌对高山微生境(风蚀脊、积雪床)的适应性及生境特化。