数据集概述
本数据集为论文“Remnant hollowed out dead coral skeleton branches defer coral community recovery”的支持数据，包含珊瑚群落恢复相关的实验数据、统计分析结果及对应的R代码脚本，共13个文件，涵盖底栖数据、无脊椎动物丰度、空位面积等核心内容，用于验证残留空心死珊瑚骨架对珊瑚群落恢复的影响。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_Scafidi_et_al_data.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据集元数据，包括项目概述、数据文件说明等信息
- 数据文件（CSV格式）
- 文件名称：post-disturbances_benthic_data_ANCOVA_plot.csv
- 字段映射介绍：包含Year（年份）、Site（站点）、Transect（样带）、Quadrat（样方）、Taxonomy（分类）、Percent_Cover（覆盖百分比）字段
- 文件名称：tagged_coral_recovery_Fisher_test.csv
- 字段映射介绍：包含标记珊瑚恢复相关的Fisher检验统计数据
- 文件名称：community_comp_PERMANOVA_heatmap.csv
- 字段映射介绍：包含Coral.ID（珊瑚ID）、Condition（状态）、Year（年份）、Month（月份）及多种珊瑚（如Acanthastrea、Acropora）和环境因子（Sand、Other）的覆盖数据
- 文件名称：invert_abund_Kruskal_test_graph.csv
- 字段映射介绍：包含无脊椎动物丰度的Kruskal检验统计及绘图数据
- 文件名称：vacant_space_area_linear_mixed_effects_model.csv
- 字段映射介绍：包含空位面积的线性混合效应模型分析数据
- 数据文件（XLSX格式）
- 文件名称：exposed_hollow_branches_2023_LTER_photos.xlsx
- 字段映射介绍：包含2023年LTER站点暴露空心珊瑚枝的照片相关数据
- 文件名称：hollow_branches_surveys.xlsx
- 字段映射介绍：包含空心珊瑚枝调查数据
- 代码文件（R格式）
- 文件名称：Tagged_coral_recovery_Fisher's test.R
- 字段映射介绍：用于标记珊瑚恢复Fisher检验的R代码
- 文件名称：Invertebrate abundance_Kuskal Wallis test and graphing.R
- 字段映射介绍：用于无脊椎动物丰度Kruskal-Wallis检验及绘图的R代码
- 文件名称：Vacant spaces_linear mixed effects model.R
- 字段映射介绍：用于空位面积线性混合效应模型分析的R代码
- 文件名称：Post-disturbances_ANCOVA+lineplot.R
- 字段映射介绍：用于扰动后底栖数据ANCOVA分析及线图绘制的R代码
数据来源
论文“Remnant hollowed out dead coral skeleton branches defer coral community recovery”（Scafidi et al. 2025）
适用场景
- 珊瑚礁生态恢复研究：分析残留空心死珊瑚骨架对珊瑚群落恢复的延缓作用
- 底栖群落动态分析：基于post-disturbances_benthic_data_ANCOVA_plot.csv研究扰动后底栖群落的变化趋势
- 统计模型验证：利用线性混合效应模型、PERMANOVA等统计方法验证生态因子对珊瑚恢复的影响
- 珊瑚礁保护策略制定：为珊瑚礁生态系统修复中如何处理残留死珊瑚骨架提供数据支持
