数据集概述
本数据集围绕树鼩(Scandentia)的系统发育位置争议展开,通过分析50种哺乳动物(含3种树鼩)的基因组数据,评估其与灵长总目、啮齿总目等类群的亲缘关系。数据集包含序列比对、表格数据及说明文档,用于探究系统发育冲突的生物与方法学因素,支持两种主要亲缘关系假说的验证。
文件详解
- README_file.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、作者信息(通讯作者及机构、合作研究者)等基本说明
- File_S1_SISRS_alignments.tar.gz
- 文件格式:TAR.GZ(压缩包)
- 字段映射介绍:SISRS方法生成的基因组序列比对数据压缩文件
- TableS2.csv.gz
- 文件格式:CSV.GZ(压缩CSV)
- 字段映射介绍:系统发育分析相关的表格数据压缩文件
- tableS1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:系统发育位置分析的表格数据文件
数据来源
罗德岛大学(University of Rhode Island)相关研究团队
适用场景
- 哺乳动物系统发育研究: 分析树鼩与灵长类、啮齿类等类群的亲缘关系,验证不同系统发育假说
- 基因组数据冲突因素探究: 研究生物因素(如不完全谱系分选、杂交)和方法学因素(如模型选择、同源性评估)对系统发育推断的影响
- 分子系统学方法评估: 比较不同系统发育信号评估方法及数据集策略(全数据集vs强信号位点)对结果的影响
- 进化生物学研究: 为哺乳动物进化关系及分类系统修订提供基因组水平的证据支持