数据集概述
本数据集用于研究墨西哥东南部高地双刺草蜥(Sceloporus bicanthalis)的种群分化过程,包含9个核基因座和线粒体DNA的多位点遗传数据,涉及47个样本的种群历史分析,划分出南部、西部普埃布拉及北部三个种群,支持晚更新世有效种群规模增长及单向基因流模式,共含7个文件。
文件详解
- 配置文件(.ctl格式)
- 文件名称:bicanthG1.ctl、bicanthA.ctl
- 文件格式:CTL
- 字段映射介绍:种群遗传分析相关的参数配置文件,用于定义分析流程中的计算参数与模型设置
- 文本文件(.txt格式)
- 文件名称:bicanth.txt、bicanthalis_mapping.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含遗传序列数据(如bicanth.txt含碱基序列信息)及样本映射关系数据
- 元数据文件(.xml格式)
- 文件名称:bicanthFOSSIL.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:化石相关的元数据记录文件
- 序列文件(.nex格式)
- 文件名称:ND1goldrun2.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:线粒体ND1基因的序列数据文件
- 输入文件(.in格式)
- 文件名称:bicanth.in
- 文件格式:IN
- 字段映射介绍:种群遗传分析的输入参数或数据文件
数据来源
论文“Phylogeography of the Trans-Volcanic bunchgrass lizard (Sceloporus bicanthalis) across the highlands of southeastern Mexico”
适用场景
- 种群遗传学研究:分析双刺草蜥的种群遗传结构、分化历史及基因流模式
- 更新世生物地理演化分析:验证晚更新世种群规模变化与地理隔离对物种分化的影响
- 爬行动物系统地理学对比:与同区域分布高地类群的系统地理模式进行比较研究
- 胎生演化机制探究:通过不同种群的生理与基因组模式对比,研究胎生性状的演化过程