数据集概述
本数据集为墨西哥南部高地Sceloporus属蜥蜴种群基因流时空范围研究的相关文件集合，包含种群遗传分析、物种界定、模拟及物种树扩散分析等相关数据，涉及148个个体的3个线粒体基因和68个个体的8个核基因数据，可用于探究该属蜥蜴种群的基因交流历史与地理分布特征。
文件详解
- 文件名称：species_tree_posterior.species.trees
- 文件格式：.trees
- 字段映射介绍：物种树后验分布文件，记录种群演化的物种树结构及相关参数
- 文件名称：STRUCTURAMA.in
- 文件格式：.in
- 字段映射介绍：STRUCTURAMA分析输入文件，用于物种界定相关的参数设置与数据输入
- 文件名称：IMa2_6pop.txt
- 文件格式：.txt
- 字段映射介绍：IMa2分析输入文件，包含种群迁移参数设置，如种群对数、迭代次数、采样参数等
- 文件名称：concatenated.nex
- 文件格式：.nex
- 字段映射介绍：序列拼接文件，采用NEXUS格式存储，包含线粒体与核基因的拼接序列数据
- 文件名称：ST_diffusion.xml
- 文件格式：.xml
- 字段映射介绍：物种树扩散分析元数据文件，记录扩散分析的参数配置与数据结构
- 文件名称：hor_N_distribution.kml
- 文件格式：.kml
- 字段映射介绍：分布数据文件，采用KML格式存储，可用于地理信息系统中展示种群分布相关数据
数据来源
论文“Estimating the temporal and spatial extent of gene flow among sympatric lizard populations (genus Sceloporus) in the southern Mexican highlands”
适用场景
- 蜥蜴种群基因流研究: 分析Sceloporus属蜥蜴种群间基因交流的时间与空间范围特征
- 物种演化历史探究: 利用物种树后验分布数据，研究该属蜥蜴的演化历程与种群分化
- 生物地理分布分析: 通过KML文件展示种群分布，结合基因流数据探究地理因素对种群的影响
- 种群遗传参数模拟: 基于STRUCTURAMA、IMa2等分析输入文件，开展种群遗传相关的模拟实验
- 基因序列数据分析: 利用拼接序列文件，进行基因序列的比对、分析与遗传多样性研究
