数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)N2品系的行为实验数据,由Schafer实验室于2010年7月16日采集。数据记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为特征,包含视频跟踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,属于线虫行为数据库的一部分。
文件详解
- 原始行为数据文件
- 文件名称:
N2 on food R_2010_07_16__10_27_41__1.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始跟踪数据,如视频帧对应的线虫位置、运动轨迹等基础信息
- 行为特征数据文件
- 文件名称:
N2 on food R_2010_07_16__10_27_41__1_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储从原始数据中提取的线虫行为特征,如运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化指标
- 标准化行为数据压缩包
- 文件名称:
N2 on food R_2010_07_16__10_27_41__1.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含采用wcon格式标准化的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究:分析N2品系线虫在食物环境中的运动模式、觅食行为及行为节律特征
- 神经生物学实验:结合线虫神经机制,研究行为特征与神经回路的关联
- 实验方法验证:验证基于tierpsy软件的线虫行为跟踪与特征提取方法的可靠性
- 模式生物数据库补充:为秀丽隐杆线虫行为数据库提供标准化的实验数据支持