数据集概述
本数据集聚焦末次冰盛期后加利福尼亚（美国）与下加利福尼亚（墨西哥）海岸的海平面变化，通过古栖息地建模与遗传混合分析，揭示冰盛期河口栖息地分布变化及生物种群 recolonization 过程。包含古栖息地面积动态、现代栖息地属性及三种河口鱼类的遗传数据，共9个文件，支持海平面变化与生物种群关联研究。
文件详解
- 遗传结构数据文件
- 文件名称：QMA_26August2013_PACb_CONVERT_5Feb2014_STRUCTURE.str、FMA28Apr2013_CONVERT_5Feb2014_STRUCTURE.str、GMA_30July2013_CONVERT_pac5Feb2014_STRUCTURE.str
- 文件格式：.str
- 字段映射介绍：包含河口鱼类种群遗传结构分析相关数据，具体字段需结合遗传分析工具（如STRUCTURE）解读
- DIYABC分析数据文件
- 文件名称：PRSB_fpa_forDIYABC_3pops_withoutFMA8,15.mss、PRSB_qyc_forDIYABC_3pops.mss、PRSB_gmi_forDIYABC_3pops.mss
- 文件格式：.mss
- 字段映射介绍：用于近似贝叶斯计算（DIYABC）的遗传数据，支持三种河口鱼类种群的遗传混合来源分析
- 古栖息地面积动态数据文件
- 文件名称：AreaPerTime26Aug2015_prsb.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含order（序号）、time（时间）、depth（深度）、region（区域）、#polygons（多边形数量）、area(km2)（面积）、min/max/mean/stdev（统计值）、standardized_area（标准化面积）等字段，记录不同时期河口栖息地面积变化
- 现代栖息地属性数据文件
- 文件名称：forTraining_ModernPolygonAttributes.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含region（区域）、observation（观测状态）、polygons（多边形数量）、summedarea（总面积）、min/max/mean/stdev（统计值）、standardizedarea（标准化面积）等字段，记录现代河口栖息地的属性特征
- 微卫星数据文件
- 文件名称：Microsatellite presence-absence data for DRYAD.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含三种河口鱼类的微卫星存在-缺失数据，支持遗传多样性与种群结构分析
数据来源
论文“Sea-level driven glacial-age refugia and post-glacial mixing on subtropical coasts, a palaeohabitat and genetic study”
适用场景
- 古气候与海平面变化研究：分析末次冰盛期至后冰期加利福尼亚海岸海平面变化对河口栖息地分布的影响
- 生物种群 recolonization 过程研究：通过遗传数据探究河口鱼类种群从冰期避难所向新栖息地的扩散与混合机制
- 栖息地动态建模：利用古栖息地面积数据与现代栖息地属性，构建海平面变化驱动的栖息地动态模型
- 种群遗传学分析：基于微卫星与遗传结构数据，研究河口鱼类的遗传多样性、种群分化及基因流模式
- 气候变化与生物响应预测：结合历史海平面变化与生物种群动态，预测未来海平面上升对沿海生物栖息地的影响
