数据集概述
本数据集基于阿尔卑斯高山湖泊沉积物DNA（sedaDNA），结合花粉、宏观遗存等传统方法，重建过去6400年植物群落演变轨迹，分析人类活动（如放牧）与非生物因素（温度、土壤演化）对植物群落的影响，揭示晚全新世农牧景观形成对植物群落的长期作用。
文件详解
- 参考数据库文件
- 文件名称：alpine_referenceDB_gh_embl.fasta、global_referenceDB_gh_embl.fasta.zip
- 文件格式：FASTA、ZIP
- 字段映射介绍：包含阿尔卑斯区域及全球植物DNA参考序列数据库，用于沉积物DNA序列的物种比对鉴定。
- 原始序列数据文件
- 文件名称：anterne_gh_raw_data_uniq.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：通过Illumina HiSeq 2500平台生成的双端测序原始序列，经OBITOOLS软件初步过滤与序列合并。
- 样本与年龄数据文件
- 文件名称：Sample_Age.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录湖泊沉积物样本的年代信息，为植物群落演变的时间序列分析提供时间标尺。
- 实验数据文件
- 文件名称：ME_Pansu_AS1-1.xlsx、ME_Pansu_AS2-1.txt
- 文件格式：XLSX、TXT
- 字段映射介绍：包含沉积物DNA序列的物种注释结果、相对丰度数据及样本分组信息，用于植物群落结构分析。
- 说明文档文件
- 文件名称：各README文件（如README_for_alpine_referenceDB_gh_embl.README等）
- 文件格式：TXT、README
- 字段映射介绍：详细说明各数据文件的生成方法、处理流程、引物信息（如g引物：5'-GGGCAATCCTGAGCCAA-3'，h引物：5'-CCATTGAGTCTCTGCACCTATC-3'）及使用说明。
数据来源
论文“Reconstructing long-term human impacts on plant communities: an ecological approach based on lake sediment DNA”
适用场景
- 古植物群落演变研究：通过沉积物DNA序列重建过去6400年阿尔卑斯高山湖泊周边植物群落的时间动态。
- 人类活动对生态系统的长期影响评估：分析农牧活动（如放牧）对植物群落结构的改变，揭示人类活动的生态效应。
- 非生物因素（温度、土壤）与植物群落的关系分析：结合温度、土壤演化数据，探讨环境因素对植物群落的驱动作用。
- 沉积物DNA分析方法验证：评估沉积物DNA在古植物群落重建中的有效性，与花粉、宏观遗存等传统方法进行对比验证。
- 古生态数据库构建：整合阿尔卑斯区域及全球植物DNA参考序列，为相关研究提供数据支持。
