数据集概述
本数据集为高山植物Senecio carniolicus（菊科）的谱系地理学研究数据，包含AFLP矩阵、质体DNA序列及贝叶斯分析模型文件，用于验证该物种在更新世冰川期于阿尔卑斯山脉内部及边缘避难所的存续模式，探究其遗传多样性分布与谱系分化机制。
文件详解
- 文件名称：SenecioCarniolicus_2x_13regions_reversible_model_run1.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：可逆模型的贝叶斯分析配置文件，包含13个区域的模型参数设置，用于谱系地理学推断。
- 文件名称：SenecioCarniolicus_2x_AFLPmatrix.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：AFLP分子标记矩阵，记录该植物二倍体谱系的AFLP基因型数据。
- 文件名称：SenecioCarniolicus_2x_plus_outgroups_uncoded_plastidSequences.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：未编码的质体DNA序列文件，包含该植物及外类群的质体基因序列数据。
- 文件名称：SenecioCarniolicus_2x_8regions_irreversible_model_run1.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：不可逆模型的贝叶斯分析配置文件，包含8个区域的模型参数设置，用于谱系地理学推断。
数据来源
论文“Extensive range persistence in peripheral and interior refugia characterizes Pleistocene range dynamics in a widespread Alpine plant species (Senecio carniolicus, Asteraceae)”
适用场景
- 高山植物谱系地理学研究: 分析Senecio carniolicus在更新世冰川期的避难所分布与谱系分化模式。
- 植物遗传多样性分析: 利用AFLP矩阵和质体DNA序列数据，研究该物种的遗传多样性水平与空间分布特征。
- 贝叶斯谱系地理学模型验证: 基于XML配置文件中的可逆/不可逆模型，验证不同模型对物种演化历史的推断效果。
- 冰川期生物避难所机制研究: 探究阿尔卑斯山脉内部及边缘避难所对植物物种存续的协同作用机制。
