Seq2science_Based_生物信息学工具补充实验数据完整包

数据集概述

该数据集为Seq2science手稿的补充数据,包含安装说明、多个重分析项目的配置文件、样本文件及质量控制报告,共15个文件,支持对Seq2science工具及相关实验分析的参考与复现。

文件详解

  • 安装说明文件:
  • installation.txt(TXT格式):记录Seq2science的安装步骤,包括通过Anaconda环境管理器安装的具体命令。
  • 配置文件(YAML格式):
  • zebrafish_alignment_config.yaml、acoel_rna_config.yaml、acoel_atac_config.yaml、zebrafish_atac_config.yaml:共4个,为各重分析项目的配置文件。
  • 样本文件(TSV格式):
  • acoel_rna_samples.tsv、acoel_atac_samples.tsv、zebrafish_atac_samples.tsv:共3个,包含样本信息,字段示例有sample、assembly、biological_replicates等。
  • 质量控制报告(HTML格式):
  • acoel_rna_QC.html、zebrafish_atac_QC.html、acoel_atac_QC.html、zebrafish_alignment_QC.html:共4个,为各实验的质量控制报告。
  • 流程图表(PDF格式):
  • DAG_rnaseq.pdf、DAG_genomic.pdf:共2个,展示实验流程的有向无环图。

适用场景

  • 生物信息学工具使用:参考Seq2science的安装与配置方法,复现相关实验分析。
  • 实验数据分析:基于样本文件和质量控制报告,分析斑马鱼、acoel等物种的测序数据。
  • 生物信息学流程研究:通过流程图表和配置文件,研究测序数据分析的流程设计与优化。
  • 学术研究参考:为相关领域的研究人员提供Seq2science手稿的补充数据支持。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 97.25 MiB
最后更新 2025年12月22日
创建于 2025年12月22日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。