数据集概述
本数据集记录了六种丝氨酸整合酶在不同真核系统(HEK 293T细胞、牛成纤维细胞、植物原生质体)及治疗相关人类细胞(PBMC、神经干细胞、胚胎干细胞)中的功能评估结果,通过细胞实验检测EGFP荧光及分子分析attL/attR位点形成,展示整合酶对靶向DNA序列的反转能力及细胞类型特异性表现。
文件详解
- 牛成纤维细胞MTT检测数据
- 文件名称:MTT_bovine_fibroblasts.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录牛成纤维细胞经丝氨酸整合酶处理后的MTT实验数据,反映细胞活性相关指标
- PBMC细胞GFP阳性率数据
- 文件名称:PBMC_GFP_ON_cell_percentage.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录外周血单个核细胞(PBMC)中GFP阳性细胞的百分比数据,反映整合酶介导的基因开关激活效率
- HEK 293T细胞GFP阳性率数据
- 文件名称:HEK_293T_GFP_ON_cell_percentage_.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录HEK 293T细胞中GFP阳性细胞的百分比数据,评估整合酶在该细胞系中的功能表现
- 人胚胎干细胞GFP阳性率数据
- 文件名称:hES_GFP_ON_cell_percentage.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录人胚胎干细胞(hES)中GFP阳性细胞的百分比数据,检测整合酶在胚胎干细胞中的活性
- 植物原生质体GFP阳性率数据
- 文件名称:Protoplasts_GFP_ON_cell_percentage.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录植物原生质体中GFP阳性细胞的百分比数据,评估整合酶在植物细胞中的功能
- 神经干细胞GFP阳性率数据
- 文件名称:NSC_GFP_ON_cell_percentage.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录神经干细胞(NSC)中GFP阳性细胞的百分比数据,检测整合酶在神经干细胞中的活性
- 牛成纤维细胞GFP阳性率数据
- 文件名称:Bovine_fibroblasts_GFP_ON_cell_percentage.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录牛成纤维细胞中GFP阳性细胞的百分比数据,评估整合酶在该细胞中的功能表现
- HEK 293T细胞MTT检测数据
- 文件名称:MTT_HEK_293T.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录HEK 293T细胞经丝氨酸整合酶处理后的MTT实验数据,反映细胞活性相关指标
数据来源
论文“Genetic switches designed for eukaryotic cells and controlled by serine integrases”
适用场景
- 真核细胞基因编辑工具开发: 分析不同丝氨酸整合酶在多种真核细胞中的功能效率,支持基因调控工具的优化与筛选
- 细胞特异性基因开关研究: 对比整合酶在HEK 293T、牛成纤维细胞、植物原生质体等不同细胞类型中的活性差异,探索细胞特异性调控机制
- 治疗用细胞基因调控评估: 研究整合酶在PBMC、神经干细胞、胚胎干细胞等治疗相关细胞中的功能,为细胞治疗领域的基因调控应用提供数据支持
- 遗传开关性能优化: 基于GFP阳性率及MTT细胞活性数据,优化丝氨酸整合酶介导的遗传开关设计,提升调控效率与细胞相容性