数据集概述
本数据集围绕精浆蛋白(SFPs)转录表达的遗传与环境变异展开研究,涉及12个近交系扁虫Macrostomum lignano在不同交配群体规模下的58个假定SFP转录本表达量测量,包含单转录本分析及主成分分析结果,揭示精浆转录组的遗传变异、环境响应及基因型-环境互作特征。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:Patlar_Data_SFPexp_2018.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含12个近交系扁虫在2或8只群体规模下的58个假定SFP转录本表达量数据,以及单转录本分析、主成分分析相关统计结果。
- 代码文件
- 文件名称:Patlar2018_RScript_SFPexpression.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于分析精浆蛋白转录表达数据的R脚本,包含数据处理、单转录本表达分析、主成分分析及基因型-环境互作检验的代码逻辑。
数据来源
论文“Genetic and environmental variation in transcriptional expression of seminal fluid proteins”
适用场景
- 性选择与性冲突机制研究:分析精浆蛋白表达变异在性选择中的作用及遗传环境调控机制。
- 分子进化研究:探究异质环境下精浆蛋白表达的遗传变异、环境可塑性及基因型-环境互作的进化意义。
- 生殖生物学研究:解析同时雌雄同体扁虫Macrostomum lignano精浆成分的调控模式与功能。
- 生物信息学分析方法应用:参考R脚本的数据分析流程,开展转录组表达量的遗传环境变异研究。