珊瑚热耐受性与环境适应性实验数据集2022_2023

数据集概述

本数据集包含珊瑚在红树林与礁区环境迁移后的基因表达、DNA甲基化、生境温盐数据及分析代码,核心围绕珊瑚热耐受性与环境适应性展开,支持珊瑚对新环境长期适应机制的研究。

文件详解

  • 基因表达数据文件:
  • HTSeqCounts.csv:CSV格式,包含四组生境(红树林转礁区、礁区转礁区、野生红树林、野生礁区)珊瑚的原始基因表达计数数据,用于RNA测序下游分析。
  • GO富集分析结果文件:
  • GO_enriched_genes_results.xlsx:XLSX格式,记录红树林与礁区来源珊瑚在热胁迫下的GO富集基因,按GO Slims大类分组,反映关键功能富集情况。
  • 生境温盐数据文件:
  • 2022-2023 Reef HOBO_Temp_pH.csv、2022-2023 Reef2 HOBO_Temp_pH.csv、2022-2023 Mangrove HOBO_Temp_pH.csv、2022-2023 Mangrove2 HOBO_Temp_pH.csv:CSV格式,包含2022-2023年Low Isles红树林泻湖与礁区的温度(Temp)、pH值等环境监测数据。
  • DNA甲基化数据文件:
  • Methylated_DNA_data.csv:CSV格式,记录不同处理组珊瑚在急性热胁迫下的DNA甲基化百分比数据。
  • 分析代码文件:
  • Analysis code GitHub.zip:ZIP格式,包含项目数据分析所用的全部R代码。

适用场景

  • 珊瑚环境适应机制研究:分析珊瑚在不同生境迁移后的基因表达与甲基化变化
  • 珊瑚热耐受性分子机制研究:探究热胁迫下珊瑚关键功能基因的富集模式
  • 海洋生态环境监测分析:结合生境温盐数据研究环境因子对珊瑚的影响
  • 生物信息学方法应用:基于提供的分析代码复现或扩展珊瑚组学数据分析流程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 9.88 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。