数据集概述
本数据集记录了山茱萸苷治疗大鼠缺血性脑卒中的实验数据,通过MCAO/R模型模拟疾病,结合16S rRNA测序、RNA测序等技术,探究其通过脑肠轴抑制IL-17F/TRAF6/NF-κB通路的机制,包含肠道菌群、神经功能、分子通路等多维度实验结果。
文件详解
该数据集按实验类型分为多个子目录,具体说明如下:
- 核心化合物文件:
- Chemical structure of cornuside.gif: GIF格式图片,展示山茱萸苷的化学结构。
- 16S rRNA测序数据 (位于16S rRNA/目录下):
- phylum.xls、family.xls、genus.xls: XLS格式文件,分别记录肠道菌群在门、科、属水平的组成数据。
- alpha_estimator_summary.xls: XLS格式文件,包含菌群α多样性评估数据。
- 神经功能评估数据 (位于Neurologicial score/目录下):
- Neurologicial score.xlsx、ABX-Neurologicial score.xlsx: XLSX格式文件,记录大鼠神经功能评分结果。
- 血脑屏障与肠道通透性数据:
- Evans blue/Evans blue.xlsx、Evans blue Standard Curve.jpg: 记录伊文思蓝实验的血脑屏障通透性数据及标准曲线。
- FITC-dextran/FITC-dextran intestinal permeability.xlsx、Standard Curve.jpg: 记录肠道通透性实验数据及标准曲线。
- RNA测序数据 (位于RNA-seq/目录下):
- E_F-vs-A_B-diff-pval-0.05-FC-2.gene.xls: XLS格式文件,包含差异表达基因列表。
- heatmap-p-val-0.05-FC-2.gene.png、Volcano map.tiff: 差异基因热图与火山图结果图。
- MF_Enrichment_Score_dotplot.png: 分子功能富集分析点图。
- 组织染色与成像数据:
- TTC/目录: 包含TTC染色评估脑梗死体积的图片文件(如MCAOR.png、Sham.png)。
- Immunofluorescence/目录: 包含ZO-1、IL-17F等蛋白的免疫荧光染色图片(如Sham.tif、CM.tif)。
- TUNEL/目录: 包含细胞凋亡检测的图片文件(如Image 19-Image Export-17_c1.tif)及定量数据CSV文件(如1.csv),CSV字段包括Slice、Count、Total Area、Average Size、%Area、Perim等。
适用场景
- 药理学研究: 分析山茱萸苷对缺血性脑卒中的治疗效果及作用机制。
- 脑肠轴机制研究: 探究肠道菌群与神经炎症、脑卒中预后的关联。
- 分子生物学研究: 解析IL-17F/TRAF6/NF-κB通路在脑卒中中的调控作用。
- 神经损伤评估: 利用神经功能评分、TTC染色等数据评估药物对神经损伤的保护效果。
- 肠道菌群研究: 分析缺血性脑卒中状态下肠道菌群结构变化及药物干预影响。