数据集概述
本数据集包含三种Sheathia属(红藻门串珠藻目)物种的多位点单倍体基因型数据及分析代码,涉及单雌雄同体、雌雄异体特性与遗传结构研究。提供GenAlEx格式的基因型文件、站点缩写说明及R分析代码,支持相关遗传分析与可视化,共含5个文件。
文件详解
- 基因型数据文件
- 文件名称:Sam_Genotypes.xlsx、Sgr_Genotypes.xlsx、Sinv_Genotypes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:分别对应Sheathia americana、Sheathia grandis、Sheathia involuta的多位点单倍体基因型数据,采用GenAlEx格式存储,包含样本遗传标记信息
- 分析代码文件
- 文件名称:Sheathia.Rmd
- 文件格式:Rmd
- 字段映射介绍:含R代码,用于数据可视化及在Genepop中计算成对连锁不平衡
- 说明文件
- 文件名称:ReadMe.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明基因型文件对应物种、站点缩写及含义(如AL_KIS对应Alabama州King Spring等20个站点)
适用场景
- 藻类遗传学研究:分析Sheathia属物种的遗传结构、单雌雄同体与雌雄异体特性关联
- 群体遗传分析:利用GenAlEx格式数据开展遗传多样性、连锁不平衡等群体遗传研究
- 生物信息学方法应用:基于R代码复现遗传数据可视化与统计分析流程
- 物种进化研究:探究三种Sheathia物种的遗传分化与进化关系