数据集概述
本数据集包含用于研究“从交互动力学中学习嵌入终身社交行为”的交互矩阵及元数据,涵盖BN16和BN19两个子数据集的交互亲和矩阵、个体存活信息、昼夜节律值、索引映射及底物停留时间等数据,支持社交行为相关分析。
文件详解
- 交互矩阵文件:
- interactions_bn16_sparse.npz、interactions_bn19_sparse.npz:压缩稀疏张量格式,存储BN16和BN19数据集的交互亲和矩阵,维度为时间×个体×个体,基于pydata/sparse库0.9.1存储
- 存活信息文件:
- alive_bn16.csv、alive_bn19.csv:CSV格式,包含个体出现日期、启发式确定的存活天数,死亡日期通过贝叶斯变点模型结合每日检测次数确定
- 昼夜节律文件:
- rhythmicity_bn16.csv、rhythmicity_bn19.csv:CSV格式,包含昼夜节律值(24小时周期正弦曲线拟合个体移动速度的R²值),用于方法评估
- 索引映射文件:
- indices_bn16.csv、indices_bn19.csv:CSV格式,包含原始标记ID与交互矩阵顺序索引的映射关系,支持双向查询
- 底物停留时间文件:
- time_spent_on_substrates.csv:CSV格式,包含个体在各类细胞底物上的停留时间占比数据,用于因子映射(对应Figure 5)
- 补充文档:
- Supporting_Information.pdf:PDF格式,提供贝叶斯变点模型、昼夜节律计算及位置映射的详细说明
适用场景
- 社交行为动力学研究:分析个体交互模式随时间的变化规律
- 生物节律分析:探究昼夜节律与社交行为的关联
- 机器学习模型训练:用于社交行为嵌入学习模型的训练与验证
- 行为生态学研究:研究群体中个体存活状态对社交网络的影响
- 空间行为分析:分析个体在不同底物上的停留时间分布特征