数据集概述
本数据集包含复现《一生的经历：通过累积效应对个体生存建模栖息地质量》研究的源代码与数据，涵盖模拟数据的生存与栖息地质量（SHQ）分析、已知命运与SHQ比较及叉角羚案例研究的完整数据与代码。
文件详解
- 文件名称：SHQ_code.zip
- 文件格式：ZIP压缩包
- 压缩包内包含以下核心内容：
- R脚本文件（位于R/目录）：
- Simulate data.R：用于模拟SHQ与已知命运生存分析的数据
- Plotting simulations.R：读取模拟结果并生成图表（图2、图3）
- Pronghorn case study.R：叉角羚案例研究的数据格式化、SHQ分析执行及图表（图4、5、6）生成
- 模型文件（位于models/目录）：
- SHQ.txt：SHQ模型代码
- Known_fate.txt：已知命运生存分析模型代码
- 结果文件（位于results/目录）：
- SHQsim_withNAs：含缺失值模拟数据集的SHQ分析MCMC结果
- SHQsim_noNAs：无缺失值模拟数据集的SHQ分析MCMC结果
- KFvsSHQ：SHQ与已知命运分析比较的MCMC结果（.RDS格式）
- 案例研究数据（位于data/目录）：
- eh.rds：叉角羚相遇历史数据（记录每日存活/死亡状态）
- fates.rds：叉角羚命运数据（含动物ID与死亡原因）
- covariatedata.rds：叉角羚每日协变量数据
适用场景
- 生态学研究：复现栖息地质量对个体生存影响的建模分析
- 统计方法验证：比较不同生存分析模型（SHQ与已知命运）的效果
- 野生动物研究：利用GPS项圈数据开展叉角羚等物种的生存分析
- 学术论文复现：生成原研究中的关键图表（图2-6）以支持相关研究
