神经元单细胞转录组亚型分类数据集_Neuron_Single_cell_Transcriptome_Subtype_Classification_Dataset
数据来源:互联网公开数据
标签:单细胞RNA测序, 神经科学, 转录组学, 细胞亚型, 数据挖掘, 生物信息学, 机器学习, 细胞注释
数据概述:
该数据集包含来自GSE147747研究的神经元单细胞RNA测序数据,记录了神经元细胞的转录组表达信息及其细胞亚型注释。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注具体时间,但研究发表于2020年。
地理范围:数据来源于特定的神经科学研究,未明确地理范围。
数据维度:
GSE147747_expr_raw_counts_table.tsv:原始基因表达计数矩阵。
GSE147747_meta_table.tsv:细胞元数据表,包含细胞的注释信息。
all_cells_20200625.h5ad:使用h5ad格式存储的单细胞对象,包含了细胞表达数据和注释信息。
slicestable.tsv:切片信息表。
snRNA_annotation_astro_subtypes_refined59_20200823.csv:星形胶质细胞亚型注释信息,包含细胞ID(Unnamed: 0)和细胞亚型注释(annotation_1)。
数据格式:包括TSV、CSV和h5ad格式,便于不同的数据分析工具使用。数据来源于相关的神经科学研究,经过了预处理和注释。
该数据集适合用于神经科学研究、单细胞转录组数据分析以及细胞亚型分类。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于神经科学、生物信息学领域的学术研究,如神经元细胞亚型识别、基因表达差异分析、细胞间相互作用研究等。
行业应用:可以为生物制药公司提供数据支持,用于药物靶点发现、神经系统疾病研究等。
决策支持:支持神经系统疾病诊断、治疗方案的制定以及药物研发。
教育和培训:作为单细胞RNA测序数据分析、生物信息学课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解神经元细胞异质性。
此数据集特别适合用于探索神经元细胞的转录组特征与其细胞亚型的关联,帮助用户实现对神经系统疾病的深入理解和精准治疗。