数据集概述
本数据集围绕时间记忆痕迹与光同步生物钟的关联研究,包含实验原始数据、FED3硬件控制代码及数据转换工具。数据覆盖PTKO与野生型样本的进食行为、转轮活动等记录,支持生物钟与记忆机制的交叉分析。
文件详解
该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下:
- 描述文档:
- Descriptions.docx: DOCX格式文档,可能包含数据集整体说明或实验背景。
- FED3运行代码 (位于FED3 Run Code/目录下):
- FED3_1.16.1_RF.ino: Arduino IDE代码文件,用于控制FED3硬件(如步进电机),支持跨午夜的进食计划编程。
- FED3.cpp: C++代码文件,包含FED3类的自定义函数,已停用蜂鸣器和LED灯。
- FED3.h: 头文件,声明FED3类,版本显示含“RF”扩展名。
- FED3数据转换工具 (位于FED3 data converter/目录下):
- FED3_analysis_v1.4.3.py: Python代码文件,用于将FED3 SD卡数据转换为ClockLab兼容的文本格式。
- 原始实验数据 (位于Raw ClockLab and FED3 data/目录下):
- 按样本类型分目录存储:
- PTKO/目录: 包含PTKO样本的实验数据,如PTKO_Experiment Procedure.xlsx(实验流程Excel文件)及编号子目录(如PTKO_11191/)。
- Wildtype/目录: 包含野生型样本的实验数据,如WT_Experiment Procedure.xlsx(实验流程Excel文件)及编号子目录(如WT_2216/)。
- 数据文件格式:
- .awd文件: 记录进食行为数据,如 pellet intake(颗粒摄入)、left/right poking(左右戳动)。
- .clklb文件: ClockLab格式文件,记录转轮活动数据(wheel running)。
数据来源
Current Biology期刊文章“A time memory engram embedded in a light-entrainable circadian clock”
适用场景
- 神经生物学研究: 分析时间记忆痕迹与生物钟的分子或行为关联机制。
- 行为学实验分析: 探究PTKO与野生型样本在光同步条件下的进食、活动节律差异。
- 生物节律工程: 基于FED3代码优化跨昼夜的动物进食行为控制方案。
- 数据转换方法研究: 参考Python工具实现神经行为数据与专业分析软件的格式兼容。