数据集概述
本数据集聚焦嗜酸性食管炎的单细胞分析，包含基因表达、细胞类型数据及分析结果。涵盖单细胞测序数据、细胞类型特异性文件、可视化图表和分析代码，为研究该疾病的细胞与分子机制提供多维度数据支持。
文件详解
- 分析代码文件（.ipynb格式）：共16个，包括step5_single_cell_bulk_scissor.ipynb（单细胞与 bulk 数据整合分析）、step6_single_cell_cellchat.ipynb（细胞通讯分析）等，用于复现数据分析流程
- 原始数据文件：
- GSE143482_bulk_count.txt.gz、GSE126250_SC_count.txt.gz：压缩格式的基因表达计数数据
- GSE126250_SC_sampleAnnotation_inferCNV.tsv：样本注释文件（用于 inferCNV 分析）
- 细胞类型特异性文件（.csv格式）：如T-helper17-(Th17)-cell.csv、Regulatory-T-(Treg)-cell.csv，包含不同细胞类型的基因表达数据
- 可视化结果文件：
- .pdf格式（144个）：如T-helper17-(Th17)-cell-Dotplot_GO.pdf（GO功能富集点图）、CellChat_Comparison_in_out.pdf（细胞通讯比较）
- .png格式（50个）：如Umap_marker_CCL5.png（UMAP可视化标记基因）、T-helper17-(Th17)-cell-Dotplot_GO.png（GO分析点图）
- 辅助文件：README.md（数据集说明）、LICENSE（许可文件）、tools.version（工具版本信息）
适用场景
- 医学研究：分析嗜酸性食管炎的细胞组成与分子机制
- 生物信息学：探究疾病状态下的细胞通讯、基因表达差异及功能富集
- 临床转化：识别疾病相关的细胞标志物与潜在治疗靶点
- 单细胞数据分析方法验证：测试细胞聚类、细胞通讯分析等算法在疾病数据中的应用效果
