数据集概述
本数据集包含两篇论文补充表格和五个文件，记录了非洲切叶菌植蚁（Crematogaster属）巢内真菌的代谢组学分析结果，涉及ITS1序列、OTU分类、系统发育树及BLAST比对结果，用于研究真菌与蚂蚁共生关系的趋同演化机制，共包含六个文件。
文件详解
- 表格文件
- 文件名称：1- Tables SA & SB.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含Table SA（OTU分类及巢样本/对照的reads数统计）、Table SB（系统发育树所用序列列表及GenBank登录号），其中Capnodiales s.l.和Chaetothyriales类群OTU标注为粗体
- 系统发育树文件
- 文件名称：2- Capno-ITS-ML-Tree.nex、3- Chaeto-ITS-ML-Tree.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：分别为Capnodiales s.l.和Chaetothyriales类群的ITS序列比对及最大似然法系统发育树，展示目标OTU的系统发育位置
- 序列数据矩阵
- 文件名称：4- Tab_Data_All_Sequences-OTU.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含id、sequence、OTU、count_CT（对照样本reads数）、count_CN1/CN2/CN3（巢样本reads数）、ali_length（比对长度）、cluster（聚类信息）等字段
- BLAST比对结果
- 文件名称：5- Blast_Results-First_50_Hits-Table-72_0TU.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录72个OTU的ITS1序列前50条BLAST比对结果，最佳匹配标注为粗体
- OTU序列列表
- 文件名称：6- Tab-OTU-Seqs.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含所有OTU的ITS1序列，其中Capnodiales s.l.和Chaetothyriales类群OTU标注为粗体
数据来源
论文“An African leaf-cutting, fungus-growing ant: a case of convergent evolution”
适用场景
- 生物趋同演化研究：分析切叶菌植蚁与真菌共生关系的趋同演化机制
- 真菌分类学研究：基于OTU分类及系统发育树，探讨巢内真菌的分类地位与亲缘关系
- 共生微生物组分析：通过代谢组学数据解析蚂蚁巢内真菌群落结构及功能
- 分子系统发育研究：利用ITS序列比对及BLAST结果，构建真菌类群的系统发育框架
- 生物共生机制研究：结合OTU丰度与序列数据，揭示蚂蚁与真菌共生的分子基础
