数据集概述
本数据集包含十字花科Physarieae族的分子系统学研究数据，涵盖ITS、LUMINIDEPENDENS（LD）核基因与ndhF叶绿体基因的序列比对文件、系统发育树文件及补充图。数据支持Physarieae族单系性及两大分支（DDNLS、PP）的划分，提升了近缘物种的系统发育分辨率，为该族进化历史及毛状体演化假说提供依据。
文件详解
- 序列比对文件（.nxs格式，共6个）
- 具体文件：ITS_trim_dataset_aligment.nxs、ITS_LD_ndhF_combined_alignment.nxs、LD_whole_data_set_alignment.nxs、LD_trim_dataset_alignment.nxs、ITS_whole_data_set_alignment.nxs、ITS_LD_combined_alignment.nxs
- 内容说明：包含不同标记（ITS、LD、ndhF）单独及组合的序列比对数据，覆盖Physarieae族7个属及外类群的样本
- 系统发育树文件（.tree格式，共6个）
- 具体文件：LD_trim_dataset_ML.tree、ITS_trim_dataset_ML.tree、LD_whole_data_set_ML.tree、ITS_LD_combined_ML_tree.tree、ITS_whole_data_set_ML.tree
- 内容说明：基于最大似然法构建的系统发育树，反映不同标记及数据组合下的物种亲缘关系
- 补充图文件（.tif格式，共2个）
- 具体文件：FigS1_ITS_224_OTUS.tif、FigS2_LD_219_OTUS.tif
- 内容说明：展示ITS、LD标记系统发育分析结果的补充图，包含224个及219个操作分类单元（OTUs）
- 图注文件（.docx格式，共1个）
- 具体文件：FIG.S1&FIG.S2_captions.docx
- 内容说明：补充图FigS1、FigS2的文字说明
适用场景
- 十字花科系统发育研究：用于分析Physarieae族的分类地位、亲缘关系及进化分支划分
- 植物分子标记应用评估：对比核基因（ITS、LD）与叶绿体基因（ndhF）在系统发育分析中的分辨率差异
- 植物进化假说验证：基于组合基因数据验证毛状体演化等生物学假说
- 植物分类学修订：为Physarieae族内属种的分类修订提供分子系统学依据
- 系统发育方法比较：分析不同数据组合（单标记、多标记联合）对系统发育树拓扑结构的影响
