数据集概述
本数据集聚焦加州野花(Limnanthes、Mimulus、Clarkia属)的传粉者介导群落组装过程,通过32个文件记录了三个属的共存矩阵、系统发育树、共识序列及日志等数据,用于分析传粉者对植物群落结构的影响,为探究生态进化力量如何塑造物种共存提供支撑。
文件详解
- 共存矩阵文件
- 格式:CSV、TXT
- 示例:Clarkia_CooccurMtrx_100m.csv、Lim_CooccurMtrx_100m.txt
- 字段:包含站点ID/物种名及各物种共存关系数值(如Mim_CooccurMtrx_30m.csv含Species列及M1-M66物种列)
- 系统发育数据文件
- 格式:.trees、.consensus
- 示例:Clarkia.trees、Limnanthes.consensus
- 内容:记录各属植物的系统发育树及共识序列
- 日志文件
- 格式:.log
- 示例:mimulus_chain1.log、Limnanthes_chain3.log
- 内容:记录分析过程中的运行日志(如链运算日志)
- 辅助数据文件
- 格式:XLSX
- 示例:Clarkia_Accessions_.xlsx
- 内容:可能包含Clarkia属植物的样本信息
数据来源
论文“Pollinator-mediated assemblage processes in California wildflowers”
适用场景
- 植物群落组装机制研究: 利用共存矩阵分析传粉者对加州野花群落结构的影响
- 传粉者生态功能评估: 探究传粉者介导的种间互作对物种共存的作用
- 系统发育群落生态学分析: 结合系统发育树数据研究群落系统发育结构
- 生态进化力量解析: 分析生态与进化力量如何共同塑造植物群落组成
- 植物属级群落比较研究: 对比Limnanthes、Mimulus、Clarkia三属的群落组装模式差异