树岛屿定义与查找及大岛屿偏差缓解数据集

数据集概述

本数据集围绕系统发育树岛屿的定义、查找方法及大岛屿偏差缓解展开,通过两栖动物系统发育关系分析案例,提出基于树间距离度量的树岛屿修订定义,介绍缓解大岛屿偏差的方法,并提供相关代码、数据及分析结果文件,为系统发育树共识构建与解释提供支持。

文件详解

  • 文档与说明文件:
  • README.md:Markdown格式,说明数据集内容、各文件用途及引用信息
  • PrintAppendices.pdf:PDF格式,包含附录内容,可能涉及方法细节或补充分析结果
  • 代码文件:
  • IslandFinder.pas:Pascal格式,树岛屿查找工具代码
  • correlationTests.r:R格式,相关性检验分析代码
  • 压缩包文件:
  • PardoPars_Islands.zip:压缩包格式,包含最简约树的TBR/SPR/NNI岛屿Nexus格式树文件
  • WeightedByIsland.zip:压缩包格式,按岛屿加权处理的相关文件
  • Data.zip:压缩包格式,包含数据矩阵及PAUP*、MrBayes分析模块文件
  • RarifiedM50.zip:压缩包格式,稀疏化M50相关文件
  • PardoPars_12-RFislands.zip:压缩包格式,基于12-RF距离的树岛屿文件
  • PartitionedByIsland.zip:压缩包格式,按岛屿划分的文件
  • MDS.zip:压缩包格式,多维尺度分析相关文件
  • 其他压缩包文件:
  • 未具体说明内容的压缩包文件,如相关分析结果或中间数据

适用场景

  • 系统发育学研究:分析树岛屿对共识树构建的影响,优化系统发育树总结方法
  • 生物进化分析:探究树岛屿揭示的进化关系及数据特征
  • 计算生物学方法开发:验证树岛屿定义与查找算法的有效性
  • 共识树解释:辅助理解系统发育分析结果中树分布的结构与意义
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数据与资源

该数据集没有数据

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.0 MiB
最后更新 2025年12月21日
创建于 2025年12月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。