数据集概述
本数据集基于水稻精英杂交种衍生的不朽F2群体,对旗叶中sRNA丰度进行遗传分析。包含53613739条独特sRNA、165797个sRNA表达性状及对应的局部和远端sQTL,还涉及sRNA簇及其表达性状的QTL定位,揭示sRNA与母基因的遗传共调控关系及生物发生基因的作用,共14个文件。
文件详解
- 补充文件集合
- 文件名称:Supplementary file 1.xls、Supplementary file 2.xls、Supplementary file 3.xlsx、Supplementary file 4.xlsx、Supplementary file 5.xlsx、Supplementary file 8.xlsx、Supplementary file 9.xls、Supplementary file 10.xlsx、Supplementary file 11.xlsx、Supplementary file 14.xlsx等(共14个文件)
- 文件格式:XLSX(11个)、XLS(3个)
- 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含sRNA序列、表达量、QTL定位结果、sRNA簇信息、遗传共调控分析数据等实验相关补充数据
数据来源
论文“Genetic basis of sRNA quantitative variation analyzed using an experimental population derived from an elite rice hybrid”
适用场景
- 水稻sRNA遗传调控机制研究:分析sRNA表达性状的QTL定位结果,探究sRNA数量变异的遗传基础
- 水稻sRNA生物发生调控分析:研究sRNA生物发生基因在sQTL热点区域的作用及对特定长度sRNA的调控
- 水稻基因表达调控研究:探索sRNA与其母基因的遗传共调控关系及对基因表达的影响
- 水稻分子育种应用:基于sRNA数量变异的遗传位点,开发水稻分子标记辅助育种的候选靶点