数据集概述
本数据集包含水蚤（Daphnia magna）种群动态实验的原始数据、处理后数据及分析脚本，用于研究选择性捕捞和食物供应随机性对种群结构、波动及非线性过程的影响。实验验证了捕捞和随机性均会增加种群波动，且捕捞会增强种群波动的非线性特征，两者均导致种群幼体化。数据集共13个文件，涵盖数据存档、分析脚本和说明文档。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称：study-data.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含实验原始数据（raw_data.csv）及处理后的数据（如滞后、缩放、一阶差分数据等），记录水蚤种群的数量、年龄结构、繁殖率等动态指标，以及捕捞处理和食物随机性处理的实验分组信息。
- 分析脚本
- 文件名称：Fig1_plot_TS.R、test-nonlinearity-composite.R、FigS3-S6_State_space_plots.R、Fig5_boxplot_cv_simulated_data.R、Fig3_boxplot_cv.R、Fitting_the_fisheries_model.R、Fig4_stability_of_fisheries_model.R、EDM_of_fisheries_model.R等（共11个.R文件）
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于生成论文图表（如时间序列图、箱线图、状态空间图）、进行非线性检验、拟合渔业模型、分析模型稳定性及经验动态建模（EDM）的代码脚本，关联实验数据与统计分析结果。
- 说明文档
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：说明数据集的来源、内容结构、文件用途及使用方法，对应论文为《Experimental evidence of size-selective harvest and environmental stochasticity effects on population demography, fluctuations, and nonlinearity》。
数据来源
论文“Experimental evidence of size-selective harvest and environmental stochasticity effects on population demography, fluctuations, and nonlinearity”
适用场景
- 种群生态学实验数据分析: 用于验证选择性捕捞和环境随机性对水蚤种群动态（如波动、非线性特征、幼体化）的影响机制。
- 渔业模型拟合与验证: 利用脚本拟合渔业模型，分析捕捞对种群繁殖率、振荡模式及 demographic noise 放大效应的作用。
- 非线性时间序列分析: 通过非线性检验脚本，研究种群波动的非线性特征及其对人为干扰的响应。
- 环境随机性与种群稳定性研究: 探究食物供应随机性对种群波动和结构的影响，为生态系统管理提供实验依据。
- 生态学教学与科研重现: 作为实验生态学和种群动态研究的案例数据，支持相关分析方法的教学实践和研究重现。
