数据1000基因组计划CEU样本Relate选择分析示例数据集

数据集概述

本数据集提供了在1000基因组计划CEU样本上运行Relate工具进行选择分析的完整示例,聚焦LCT基因附近区域,包含构建Relate树及使用RelateSelection模块计算选择p值的流程与结果,输出数据集中每个SNP的选择p值。

文件详解

  • 文件名称: plot_manh.pdf
  • 文件格式: PDF
  • 内容说明: 曼哈顿图文件,可能展示LCT基因区域SNP的选择分析结果可视化
  • 文件名称: relate_1000G_LCT.tgz
  • 文件格式: TGZ(压缩包)
  • 内容说明: 包含LCT基因区域CEU样本数据、Relate树构建结果及选择p值计算所需的相关文件

适用场景

  • 群体遗传学研究: 分析LCT基因区域的自然选择信号
  • 生物信息学方法验证: 验证Relate工具在选择分析中的应用流程
  • 基因组学教学: 作为演示群体遗传选择分析的案例数据
  • 人类进化研究: 探究CEU人群中乳糖耐受相关基因的进化机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 83.6 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
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