数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫NL792 gpc-1(pk298)X品系的行为实验数据,包含成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的运动行为记录。实验由英国MRC分子生物学实验室完成,采用tierpsy软件追踪分析,记录了线虫的运动轨迹、骨架特征等数据,是研究gpc-1基因功能与线虫行为关系的基础资料。
文件详解
- 实验数据文件:
- 文件名称:
gpc-1 (pk298)X on food R_2010_03_09__15_15_28__9.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为实验的原始追踪数据,可能涵盖视频帧对应的线虫位置、运动参数等基础信息
- 特征数据文件:
- 文件名称:
gpc-1 (pk298)X on food R_2010_03_09__15_15_28__9_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于20325个分段骨架计算,可能涵盖运动速度、弯曲度、轨迹特征等分析指标
- 压缩数据文件:
- 文件名称:
gpc-1 (pk298)X on food R_2010_03_09__15_15_28__9.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的压缩数据,可能为线虫行为数据的标准化交换格式文件
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析gpc-1(pk298)突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为学特征提取:基于分段骨架数据研究线虫运动模式、轨迹特征等行为学指标
- 生物图像追踪算法验证:利用标准化实验数据测试或优化线虫行为追踪软件的性能
- 模式生物实验复现:为相关实验室复现NL792品系线虫行为实验提供原始数据参考