数据集概述
本数据集包含323名健康个体(300BCG队列)接种卡介苗(BCG)前后的免疫特征数据,样本采集于接种前(第0天)、接种后14天和90天。数据涵盖免疫细胞浓度、73种循环炎症标志物血浆浓度,以及外周血单个核细胞对四种微生物刺激的细胞因子和乳酸生成能力测量结果,共13个文件。
文件详解
- 数据文件(CSV格式)
300BCG_cytokine_production_capacity.csv:细胞因子生成能力测量数据,包含样本ID及不同刺激下的细胞因子水平
300BCG_cytokine_production_capacity_names.csv:细胞因子生成能力数据的字段名称映射
300BCG_whole_blood_million_per_ml_concentrations.csv:全血免疫细胞浓度数据(单位:百万/毫升)
300BCG_whole_blood_million_per_ml_concentrations_names.csv:免疫细胞浓度数据的字段名称映射
300BCG_circulating_inflammatory_markers.csv:循环炎症标志物血浆浓度数据
300BCG_circulating_inflammatory_markers_names.csv:循环炎症标志物的字段名称映射
- 数据文件(XLSX格式)
unprocessed_flow_cytometry_whole_blood.xlsx:未处理的全血流式细胞术数据
unprocessed_sysmex_PBMCs.xlsx:未处理的外周血单个核细胞血常规数据
- 代码文件(IPYNB格式)
cell_fractions_from_concentrations.ipynb:从细胞浓度计算细胞比例的代码
impute_PBMC_cell_fractions.ipynb:外周血单个核细胞比例插补的代码
- 文档文件(MD格式)
!README.md:数据集说明文档,包含研究背景、数据内容及使用说明
数据来源
300BCG队列研究(http://300BCG.bocklab.org/)
适用场景
- 疫苗免疫机制研究:分析BCG疫苗接种后先天免疫与适应性免疫的动态变化
- 表观遗传细胞状态分析:探索预测训练免疫的表观遗传细胞状态标志物
- 炎症反应特征研究:利用循环炎症标志物数据,分析疫苗接种后的炎症反应模式
- 免疫应答预测模型构建:基于免疫特征数据开发疫苗免疫应答的预测模型
- 微生物刺激反应研究:分析外周血单个核细胞对不同微生物刺激的免疫反应差异