数据集概述
本数据集为5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型研究的补充数据，包含七份文件，涵盖基因表达谱、miRNA靶标、节点网络、相关性分析、引物序列及原始数据等内容，支持神经元-胶质相关基因与炎症miRNA时空失调的研究验证与分析。
文件详解
- Supplementary Table1_Non-significant genes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录RT-qPCR分析的基因表达谱，包含基因型（WT/5xFAD）、年龄（6/9个月）、脑区（海马HPC/前额叶皮层PFC）等分组下无显著差异的基因数据
- Supplementary Table2_mirNET_Targets lists.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：通过mirNET平台获取的分析用microRNA及其靶基因列表
- Supplementary Table3_mirNET_nodes.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：mirNET平台生成的节点表，仅包含节点度至少为2的microRNA和/或靶基因
- Supplementary Table4_Pearson_PValues.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：所有microRNA与基因间的双变量Pearson相关系数及对应p值
- Supplementary Table5_microRNA primers.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：RT-qPCR分析所用microRNA的引物序列列表
- Supplementary Table6_transcripts primers.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：mRNA分析所用基因转录本的引物序列列表
- Supplementary Table7_R_Raw data HPC and PFC.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：使用RStudio软件cor函数进行海马和前额叶皮层相关性分析的原始数据
数据来源
论文“Spatiotemporal dysregulation of neuron-glia related genes and pro-/anti-inflammatory miRNAs in the 5xFAD mouse model of Alzheimer's disease”
适用场景
- 阿尔茨海默病分子机制研究: 分析5xFAD小鼠模型中神经元-胶质基因与炎症miRNA的时空表达变化
- miRNA靶基因网络分析: 基于mirNET生成的靶标列表和节点表，构建并研究miRNA-基因调控网络
- 基因表达相关性验证: 利用Pearson相关系数数据，验证基因与miRNA间的表达关联
- 实验方法复现: 通过引物序列文件，复现RT-qPCR检测基因和miRNA表达的实验流程
- 生物信息学分析原始数据支撑: 使用原始数据文件进行自定义的相关性分析或其他统计分析
