数据集概述
本数据集为布氏锥虫Lister 427菌株（Tb427）的基因组组装数据，包含0.0.3版本发布的v12和v11两个版本的基因组组装文件。v12版本提供了不同类型的组装形式（coreA、coreB、二倍体、二倍体 scaffolded），v11版本包含二倍体 scaffolded组装，所有组装文件均附带序列和注释信息。
文件详解
- Tb427v12.zip
- 文件格式：ZIP
- 包含子文件夹：
- Tb427v12_coreA：拆分核心区（仅A等位基因）和端粒亚端区（含两个等位基因）的组装，含.fasta序列文件和.gff注释文件
- Tb427v12_coreB：拆分核心区（仅B等位基因）和端粒亚端区（含两个等位基因）的组装，含.fasta序列文件和.gff注释文件
- Tb427v12_diploid：拆分核心区和端粒亚端区（均含两个等位基因）的组装，含.fasta序列文件和.gff注释文件
- Tb427v12_diploid_scaffolded：核心区和端粒亚端区合并的二倍体组装，含.fasta序列文件和.gff注释文件
- Tb427v11.zip
- 文件格式：ZIP
- 包含子文件夹：
- Tb427v11_diploid_scaffolded：含所有兆碱基染色体两个等位基因的scaffolded组装
- Rabuffo_et_al_Tb427v12_assembly_pipeline-0.0.3.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容：0.0.3版本的基因组组装流程相关文件
数据来源
Siegel-Lab/Rabuffo_et_al_Tb427v12_assembly_pipeline: Version 0.0.3
适用场景
- 布氏锥虫基因组结构研究: 分析不同组装形式（coreA、coreB、二倍体）的基因组结构特征
- 寄生虫分子生物学研究: 基于基因组序列和注释数据开展基因功能、表达调控等研究
- 基因组版本对比分析: 比较v12与v11版本基因组组装的差异及改进
- 锥虫病相关研究: 为布氏锥虫致病机制、药物靶点筛选等应用提供基础基因组数据
