斯里兰卡陆生蜗牛Corilla的CO1_ND1_16S_rRNA串联DNA序列比对数据集

数据集概述

本数据集包含斯里兰卡陆生蜗牛Corilla(柄眼目:Corillidae科)的三个线粒体基因(CO1、ND1、16S rRNA)的四组串联序列比对数据,含插入缺失(indels),用于基于线粒体DNA的分类学研究,所有序列使用MAFFT v.7软件进行比对。

文件详解

该数据集包含四个FAS格式的序列比对文件,具体说明如下: - 1_Corilla47seq.fas:FAS格式,含Corilla属42个样本及5个其他陆生蜗牛类群(Albinaria caerulea等)的CO1、ND1、16S rRNA串联比对序列,基因位置:CO1(1-459 bp,密码子位置2起始)、ND1(460-891 bp,密码子位置3起始)、16S(892-2166 bp) - 2_Corilla45seq.fas:FAS格式,含Corilla属40个样本及5个其他陆生蜗牛类群的CO1、ND1、16S rRNA串联比对序列,基因位置:CO1(1-459 bp,密码子位置2起始)、ND1(460-891 bp,密码子位置3起始)、16S(892-2163 bp) - 3_Corilla42seq.fas:FAS格式,含Corilla属42个样本的CO1、ND1、16S rRNA串联比对序列,基因位置:CO1(1-459 bp,密码子位置2起始)、ND1(460-899 bp,密码子位置3起始)、16S(900-1361 bp) - 4_Corilla40seq.fas:FAS格式,含Corilla属40个样本的CO1、ND1、16S rRNA串联比对序列,基因位置:CO1(1-459 bp,密码子位置2起始)、ND1(460-899 bp,密码子位置3起始)、16S(900-1360 bp)

适用场景

  • 软体动物分类学研究:基于线粒体DNA序列验证Corilla属的贝壳形态分类系统
  • 分子系统发育分析:构建Corilla属及近缘类群的系统发育树
  • 种群遗传学研究:分析Corilla属不同样本的遗传多样性与亲缘关系
  • 生物信息学方法验证:测试线粒体基因串联比对在陆生蜗牛分类中的应用效果
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.04 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
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