SimpleTidy_GeneCoEx仓库示例基因表达矩阵数据集

数据集概述

本数据集是SimpleTidy_GeneCoEx仓库使用的示例基因表达矩阵，由kallisto生成，数据来源于Shinozaki等人2018年的研究，包含代表性转录本的TPM表达数据，为基因共表达分析相关研究提供示例数据支持。

文件详解

• 文件名称：Shinozaki_tpm_representative_transcripts.zip
• 文件格式：ZIP（.zip）
• 文件内容：包含由kallisto生成的基因表达矩阵数据，具体字段映射需解压后查看原始文件结构

数据来源

Shinozaki et al., 2018（DOI: 10.1038/s41467-017-02782-9）

适用场景

• 生物信息学工具测试：用于验证SimpleTidy_GeneCoEx等基因共表达分析工具的功能与性能
• 转录组数据分析教学：作为基因表达矩阵处理与分析的示例数据，辅助相关技术教学
• 基因共表达研究预实验：为探索基因表达模式、构建共表达网络提供基础数据支持
• 生物信息学方法比较：可作为基准数据，用于比较不同基因表达数据处理方法的差异