数据集概述
本数据集围绕南部非洲蜣螂属(Sisyphus)展开,探究晚新生代地质抬升与气候变化对其多样化模式的影响。包含分子系统发育、物种分布气候聚类、祖先分布区估算、谱系时间动态、多样化模型及生态位建模等相关分析文件,共16个文件,用于支撑该属分类与生态气候分化的研究结论。
文件详解
- 代码文件
- 文件名称:LTT_script.R、TESS_Oralensis.R
- 文件格式:.R
- 字段映射介绍:用于谱系时间动态分析(LTT)和多样化模型计算的R脚本
- 文档文件
- 文件名称:Figures_supplementary.docx、Tables_S1-6_revised.doc
- 文件格式:.docx、.doc
- 字段映射介绍:包含补充图表和修订表格,记录研究中的分类、分布及分析结果
- 统计数据文件
- 文件名称:Statistic_summary_for_Biogeographic_model_testing_in_BIOGEOBEARS.xlsx
- 文件格式:.xlsx
- 字段映射介绍:生物地理模型测试的统计摘要数据,支撑祖先分布区估算分析
- 系统发育树文件
- 文件名称:RAXML_tree、Bayesian.nex.con.tre、BEAST.trees
- 文件格式:无扩展名、.tre、.trees
- 字段映射介绍:基于不同方法构建的分子系统发育树,记录物种演化关系及时序
- 可视化结果文件
- 文件名称:extinction_Bayes_factors.tif、Fig._S1.tif、Fig._S2.tif、Geweke_statistic_extinction_rates.tif、mass_extinction_Bayes_factors.tif等共8个.tif文件
- 文件格式:.tif
- 字段映射介绍:多样化模型的贝叶斯因子、统计检验结果及补充图表的图像文件
数据来源
论文“Evolutionary history and eco-climatic diversification in southern African Sisyphus (Coleoptera: Scarabaeidae: Scarabaeinae)”
适用场景
- 生物地理学研究: 利用祖先分布区估算数据,分析蜣螂属在南部非洲的地理扩散与分化历史
- 气候变化与物种多样化分析: 通过谱系时间动态和多样化模型结果,探究晚新生代气候与地质变化对物种形成的影响
- 生态位建模验证: 结合生态位建模输出,分析当前气候条件下蜣螂属物种的栖息地适宜性分布
- 系统发育方法应用: 参考不同系统发育树构建及分析脚本,支撑相关类群的分子演化研究
- 生物多样性保护: 基于物种分布气候聚类结果,识别蜣螂属关键分布区域及保护优先级