数据集概述
本数据集为四足动物近缘种识别的系统发育基因组研究数据，包含用于解决早期肉鳍鱼类分化短深节点的多文件数据，涉及基因序列块、分析脚本及补充文档，支持脊椎动物系统发育学中四足动物近缘种的研究。
文件详解
- 基因序列块文件（.nex格式）：共7个，包含不同条件处理的序列数据块，如1821_heterog_blocks.nex（异质性序列块）、251_homog_blocks.nex（同质性序列块）、2960_smx_3lf.nex（混合模型序列块）等，用于系统发育分析。
- 分析脚本文件（.pl格式）：共4个，包括parse_tree_check_outparalogs.pl（树解析与旁系同源基因检查脚本）、clade_support_from_site_patterns.pl（分支支持度计算脚本）等，用于数据处理与系统发育树分析。
- 补充文档：Irisarri_Meyer_supplement_20160607.pdf（PDF格式），为研究补充材料，提供实验方法、数据分析细节等背景信息。
适用场景
- 脊椎动物系统发育研究：分析四足动物与肺鱼、腔棘鱼等类群的亲缘关系。
- 系统发育基因组方法验证：测试混合模型、多物种溯祖模型等在解决短深进化节点中的性能。
- 系统误差校正研究：评估长枝吸引、组成异质性等系统误差对发育树重建的影响及校正策略。
- 基因序列数据分析：探索RNA-seq数据在大基因组物种（如肺鱼）系统发育研究中的应用。
