数据集概述
本数据集基于特定长度扩增片段测序(SLAF-seq)技术,对长江支流太白河3个地点的43尾四川哲罗鲑(Hucho bleekeri)幼鱼进行全基因组SNP标记分析,评估其近交水平和遗传相关性。数据显示该隔离种群近交水平较低,群体内和群体间的共祖系数均接近0,遗传分化与地理距离呈负相关,43个个体可分为2个遗传独立群体。数据集包含10个文档文件。
文件详解
- 文档文件(共10个,格式均为DOCX)
- Table_S1_Reads.docx:可能包含测序reads的基础信息
- Table_S3_SNP.docx:可能包含全基因组SNP标记的相关数据
- Table_S4_Reads_maped.docx:可能包含reads比对的统计信息
- Table_S5_Inbreeding_F.docx:可能包含近交系数(F)的计算结果
- Table_S6_Comparison_between_populations_for_F.docx:可能包含群体间近交系数的比较数据
- Table_S7_θ_IBD_D_IBS.docx:可能包含IBD(身份-by- descent)和IBS(身份-by- state)相关系数数据
- Table_S8_Comparison_within_populations_for_θ_IBD_D_IBS.docx:可能包含群体内IBD和IBS系数的比较数据
- Table_S9_Comparison_between_populations_for_θ_IBD_D_IBS.docx:可能包含群体间IBD和IBS系数的比较数据
适用场景
- 濒危鱼类保护遗传学研究:用于分析四川哲罗鲑隔离种群的近交水平和遗传多样性,为保护策略制定提供依据
- 基因组学辅助育种:基于遗传相关性数据,指导无系谱记录的野生鱼类的育种计划
- 种群遗传结构分析:研究隔离种群的遗传分化模式及其与地理距离的关系
- 生物多样性监测:评估长期隔离对濒危鱼类种群遗传健康的影响
- 保护生物学决策支持:为IUCN红色名录物种的保护优先级设定提供科学数据